在建工程审计的目标主要是确定在建工程是否存在、所有权的归属、本年度增减变化的记录完整、减值准备计提方法是否恰当，以及会计报表披露是否恰当等。以下是一些常用的审计程序：
复核加计正确性，并与报表数、总账数和明细账合计数核对相符。
了解在建工程相关预算、结算、决算资料，在建工程核算政策、相关工程合同、协议等法律文件。
检查在建工程交付使用、竣工、完工情况及工程进度等。
实地观察工程现场，确定在建工程是否存在。
确定在建工程在资产负债表上的披露是否恰当
。看图法
仔细查看所有施工图纸，核实工程量与工程价款，审定工程造价。
-亲临建筑现场，实地观察，了解建设项目的实际情况，发现疑点，验证事实。
询问被审计单位参与基建项目管理的负责人、当事人、知情人或施工单位施工员、预算员、知情者，以证实基建工程量与工程价款的真实性、合理性。
深入实际进行调查研究，查证基建工程量与工程价款的真实性、合理性。例如，对水电主材价格进行市场调查分析。
对有疑点的隐蔽工程进行挖开核实工程量与工程价款。
运用各种系统方法，对基建工程项目的具体内容进行分离和分类，然后综合分析，发现疑点，揭露问题。
实地测量有关工程量，计量有关器材物质数量，确定核实基建工程决算工程量与造价的真实性、合理性。
用一种记录或资料同另一种记录或资料进行查对，验证基建工程决算工程量与造价的真实性、合理性。
收集工程相关的文件资料，熟悉竣工图纸，了解决算包括的范围，弄清所采用的单位估价表。
在建设项目正式立项时将其纳入审计视野，关注各项前期准备工作，设立办公场所，参加被审计单位的重要例会，及时了解项目有关情况。
审查项目投资程序执行情况，建设资金的筹措与保障情况，招标制度等。
审查建设项目实施过程中的工作进度、施工质量、工程监理和投资控制。
以相关标准和规范为依据，结合项目过程管理审查与财务审计，实施事前、事中和事后审计，注意与项目各专业管理部门的协调和合作。
通过以上程序和方法，审计人员可以全面、准确地评估在建工程的实际情况，确保财务报表的真实性和可靠性。
