如果个体工商户的营业执照副本丢失，可以按照以下步骤进行注销：
首先，需要到当地的地市级以上报纸刊登遗失声明，声明丢失的营业执照作废。声明中应注明营业执照的注册号、经营者姓名、字号名称等内容。
携带刊登了遗失声明的报纸原件和身份证复印件，到当初办理营业执照的工商部门申请补办营业执照正副本。
补办完营业执照后，需要准备以下材料进行注销：
经营者签署的《个体工商户注销登记申请书》。
经营者的身份证复印件。
如果委托代理人办理，还需提交经营者签署的《委托代理人证明》及委托代理人身份证复印件。
家庭经营的个体工商户，需要全体参加经营的家庭成员在《个体工商户注销登记申请书》上签字确认。
营业执照正本及所有副本。
国家工商行政管理总局规定提交的其他文件。
将准备好的注销材料提交给工商部门，按照法定条件和程序进行核实。审核通过后，工商部门会出具注销通知书。
在办理工商注销之前，还需要到国税、地税等部门开具清税证明，完成税务注销。具体流程包括到税务所申请税务注销，进行税务注销，并领取税务注销通知书。
如果公司银行账户中还有资金，需要全部转走并进行银行销户。销户时须携带开户的所有资料，包括营业执照正副本、税务登记证正副本、银行开户许可证、机构信用代码证、法人身份证和经办人身份证原件及复印件，公章、财务专用章、名章等。
最后，携带营业执照正本、税务局出具的税务事项通知书原件及复印件、公章等文件，到工商局办理营业执照注销手续。
通过以上步骤，即使营业执照副本丢失，也可以顺利完成注销手续。建议在办理过程中，每一步都仔细检查，确保材料齐全，并按照规定的流程操作。
